Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms