Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND5BQ6ZUT9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND5BQ6ZUT9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND5BQ6ZUT9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms