Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE3Q6ZMZ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms