Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZRN4Q6ZMN7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms