Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC171Q6TFL3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms