Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTR9Q6PD62 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms