Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102BQ68D86 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms