Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms