Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms