Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms