Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms