Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C10orf55Q5SWW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms