Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAP1Q5SW96 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms