Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms