Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF260Q3ZCT1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF260Q3ZCT1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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