Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms