Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL40Q2TBA0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL40Q2TBA0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms