Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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