Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.871e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.881e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)9.48□□□□□ -0.891e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.911e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.971e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-225ENST00000532438 740 ntTSL 48.96□□□□□ -0.981e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 28.63□□□□□ -1.035e-13■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-210ENST00000526342 474 ntTSL 58.1□□□□□ -1.111e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.421e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.953e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.243e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.343e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ATAD2-202ENST00000517666 4995 ntTSL 510.14□□□□□ -0.791e-9■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.791e-9■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 ATAD2-204ENST00000521496 3133 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.941e-9■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.231e-9■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.571e-9■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -02e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.52e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 RNF213-216ENST00000573548 616 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 RNF213-207ENST00000559070 4644 ntTSL 1 (best)9.19□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.442e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.662e-6■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.895e-7■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.355e-7■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.55e-7■■□□□ 11.8
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SRSF7Q16629 SNHG25-201ENST00000580828 106 ntTSL 29.53□□□□□ -0.887e-10■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 ACSL4-210ENST00000505855 587 ntTSL 44.15□□□□□ -1.752e-11■■□□□ 11.8
SRSF7Q16629 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.237e-8■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.397e-8■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.617e-8■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 53.6□□□□□ -1.833e-10■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.511e-10■■□□□ 11.7
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SRSF7Q16629 KEL-209ENST00000494148 417 ntTSL 39.13□□□□□ -0.953e-6■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-6■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-17■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.371e-17■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.581e-17■■□□□ 11.7
SRSF7Q16629 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.651e-17■■□□□ 11.7
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SRSF7Q16629 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.523e-6■■□□□ 11.6
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SRSF7Q16629 FGD5-AS1-203ENST00000426200 1874 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.443e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-207ENST00000562708 672 ntTSL 517.74■□□□□ 0.431e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-214ENST00000566214 683 ntTSL 517.74■□□□□ 0.431e-8■■□□□ 11.6
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SRSF7Q16629 RHOT2-219ENST00000568950 1343 ntTSL 517.29■□□□□ 0.361e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 11.6
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SRSF7Q16629 RHOT2-210ENST00000563637 993 ntTSL 515.09■□□□□ 0.011e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 FGD5-AS1-205ENST00000440079 1527 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.093e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-215ENST00000566965 879 ntTSL 514.23□□□□□ -0.131e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-211ENST00000563776 923 ntTSL 313.98□□□□□ -0.171e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 213.91□□□□□ -0.181e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-206ENST00000562598 612 ntTSL 312.8□□□□□ -0.361e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.383e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-227ENST00000602564 3695 ntTSL 512.56□□□□□ -0.41e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-222ENST00000536424 594 ntTSL 512.09□□□□□ -0.473e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-224ENST00000569943 635 ntTSL 311.64□□□□□ -0.551e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.61e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 RHOT2-203ENST00000561929 625 ntTSL 210.63□□□□□ -0.711e-8■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.843e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.893e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-218ENST00000513762 3581 ntTSL 39□□□□□ -0.973e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -13e-6■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.063e-13■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.153e-13■■□□□ 11.6
SRSF7Q16629 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.213e-6■■□□□ 11.6
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