Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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ZNF56Q15929 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF56Q15929 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF56Q15929 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF56Q15929 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF56Q15929 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ZNF56Q15929 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF56Q15929 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF56Q15929 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF56Q15929 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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