Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS72Q15906 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS72Q15906 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
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