Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCEA2Q15560 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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