Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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