Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PDK1Q15118 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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