Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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