Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
R3HDM1Q15032 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms