Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)23.41■■□□□ 1.341e-7■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.613e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 518.17■□□□□ 0.53e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.373e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.353e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 212.51□□□□□ -0.413e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-202ENST00000396527 1169 ntTSL 28.91□□□□□ -0.983e-6■■■□□ 15.3
NOLC1Q14978 ALB-217ENST00000514786 577 ntTSL 45.31□□□□□ -1.561e-323■■■□□ 15.2
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NOLC1Q14978 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 212.3□□□□□ -0.443e-89■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-89■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.113e-89■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.815e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.615e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.315e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.275e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 CRELD1-205ENST00000435417 966 ntTSL 515.6■□□□□ 0.095e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 CRELD1-209ENST00000482691 690 ntTSL 315.21■□□□□ 0.035e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 GANAB-207ENST00000526732 824 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-13■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-212ENST00000433104 2490 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-227ENST00000479914 1077 ntTSL 1 (best)18.75■□□□□ 0.592e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.522e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-207ENST00000416707 1260 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.052e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-220ENST00000449563 580 ntTSL 414.44□□□□□ -0.12e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.112e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-206ENST00000413654 553 ntTSL 413.57□□□□□ -0.242e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.242e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-224ENST00000454335 631 ntTSL 413.26□□□□□ -0.292e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 IP6K2-204ENST00000412850 543 ntTSL 411.35□□□□□ -0.592e-8■■■□□ 15.2
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NOLC1Q14978 IP6K2-217ENST00000443853 579 ntTSL 39.67□□□□□ -0.862e-8■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 EEF1A1-205ENST00000455918 701 ntTSL 221.6■■□□□ 1.053e-30■■■□□ 15.2
NOLC1Q14978 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 524.08■■□□□ 1.458e-7■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.888e-7■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 220.17■□□□□ 0.828e-7■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.618e-7■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 211.66□□□□□ -0.548e-7■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 STAG2-215ENST00000469481 989 ntTSL 317.03■□□□□ 0.323e-13■■■□□ 15.1
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NOLC1Q14978 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.553e-13■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.573e-13■■■□□ 15.1
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NOLC1Q14978 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.369e-7■■■□□ 15.1
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NOLC1Q14978 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.384e-9■■■□□ 15.1
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NOLC1Q14978 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.024e-9■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.276e-11■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.146e-11■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.036e-11■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.796e-11■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.936e-11■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.946e-11■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.136e-11■■■□□ 15.1
NOLC1Q14978 ALB-206ENST00000484992 693 ntTSL 24.66□□□□□ -1.661e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SNHG3-203ENST00000447507 185 ntTSL 1 (best)1.84□□□□□ -2.113e-28■■■□□ 15
NOLC1Q14978 RPL34-205ENST00000503574 2627 ntTSL 210.53□□□□□ -0.721e-20■■■□□ 15
NOLC1Q14978 CNOT1-212ENST00000567285 722 ntTSL 46.8□□□□□ -1.321e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.821e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.361e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SNHG8-203ENST00000602520 327 ntTSL 28.24□□□□□ -1.091e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.351e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SNHG8-204ENST00000602573 570 ntTSL 25.8□□□□□ -1.481e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.081e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 513.12□□□□□ -0.313e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 IST1-206ENST00000456820 2031 ntTSL 511.97□□□□□ -0.493e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.663e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.843e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 APP-211ENST00000462267 667 ntTSL 216.54■□□□□ 0.242e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 APP-214ENST00000466453 374 ntTSL 38.38□□□□□ -1.072e-12■■■□□ 15
NOLC1Q14978 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 219.28■□□□□ 0.681e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 227.78■■■□□ 2.041e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.341e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 316.88■□□□□ 0.291e-323■■■□□ 15
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