Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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RAB39AQ14964 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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RAB39AQ14964 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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RAB39AQ14964 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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RAB39AQ14964 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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RAB39AQ14964 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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RAB39AQ14964 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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RAB39AQ14964 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB39AQ14964 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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