Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
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