Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BECN1Q14457 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms