Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNQ14247 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTTNQ14247 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNQ14247 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms