Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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