Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKP1Q13835 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP1Q13835 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
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