Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CUL3Q13618 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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