Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRQ13535 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRQ13535 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRQ13535 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRQ13535 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRQ13535 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRQ13535 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRQ13535 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRQ13535 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRQ13535 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRQ13535 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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