Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF4BQ13523 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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