Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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