Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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