Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL49Q13405 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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