Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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