Protein–RNA interactions for Protein: Q12979

ABR, Active breakpoint cluster region-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRQ12979 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRQ12979 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRQ12979 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRQ12979 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABRQ12979 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRQ12979 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRQ12979 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRQ12979 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRQ12979 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRQ12979 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms