Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms