Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 KIN2YLR096W 3444 nt4.38□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 NPL4YBR170C 1743 nt4.38□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 ARX1YDR101C 1782 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 PHO84YML123C 1764 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YPK3YBR028C 1578 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YML020WYML020W 1995 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 UBC8YEL012W 657 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YFR045WYFR045W 930 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 RPS4BYHR203C 786 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 RPS4AYJR145C 786 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 SPC3YLR066W 555 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YOR131CYOR131C 657 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 VAC7YNL054W 3498 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 SSB1YDL229W 1842 nt4.37□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 MSK1YNL073W 1731 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YOL153CYOL153C 1746 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 BUD30YDL151C 582 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 SPO16YHR153C 597 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 RPS1BYML063W 768 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 POP4YBR257W 840 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 IME4YGL192W 1803 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 BUD8YLR353W 1812 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 DIT2YDR402C 1470 nt4.36□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 LYS2YBR115C 4179 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 MNN1YER001W 2289 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YDL228CYDL228C 642 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YIL171WYIL171W 330 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YAR030CYAR030C 342 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 MDM12YOL009C 816 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 FLC1YPL221W 2382 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 LAS1YKR063C 1509 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YCR023CYCR023C 1836 nt4.35□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 SRS2YJL092W 3525 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 STV1YMR054W 2673 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 DPB4YDR121W 591 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 NSE3YDR288W 912 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 DUO1YGL061C 744 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 MRP13YGR084C 1020 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 YJL218WYJL218W 591 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 ISA1YLL027W 753 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 CDA2YLR308W 939 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 MRPL3YMR024W 1173 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 POP3YNL282W 588 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 VPS69YPR087W 321 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 ABD1YBR236C 1311 nt4.34□□□□□ -1.71
VPS54Q12071 RPG1YBR079C 2895 nt4.34□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 BRE4YDL231C 3378 nt4.34□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RRN11YML043C 1524 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 TYR1YBR166C 1359 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 PTC1YDL006W 846 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YFT2YDR319C 825 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 SEC72YLR292C 582 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 HEK2YBL032W 1146 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YMR114CYMR114C 1107 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 ERD2YBL040C 660 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 ATG8YBL078C 354 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 SUI1YNL244C 327 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 SNF2YOR290C 5112 nt4.33□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RAD7YJR052W 1698 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RKM3YBR030W 1659 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 SPC105YGL093W 2754 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 PRP19YLL036C 1512 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RSC58YLR033W 1509 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RCM1YNL022C 1473 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 TOG1YER184C 2385 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 PUF2YPR042C 3228 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 MIC26YGR235C 702 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 TTI2YJR136C 1266 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 DSS4YPR017C 432 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YCL022CYCL022C 516 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YER077CYER077C 2067 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RDH54YBR073W 2877 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 HOYDL227C 1761 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 MIH1YMR036C 1665 nt4.32□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 PHO13YDL236W 939 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 THI13YDL244W 1023 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YAE1YJR067C 426 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 THI11YJR156C 1023 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YMR085WYMR085W 1299 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 SPS4YOR313C 1017 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YPL077CYPL077C 723 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 SHE3YBR130C 1278 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 PEX30YLR324W 1572 nt4.31□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RTK1YDL025C 1863 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 NAM2YLR382C 2685 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 FAR10YLR238W 1437 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 ALR2YFL050C 2577 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 CDC15YAR019C 2925 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 APC1YNL172W 5247 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 TRS85YDR108W 2097 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 SCL1YGL011C 759 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RPL24AYGL031C 468 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YLR049CYLR049C 1287 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 PER33YLR064W 822 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 BOI2YER114C 3123 nt4.3□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 IDS2YJL146W 1410 nt4.29□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 PTR3YFR029W 2037 nt4.29□□□□□ -1.72
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