Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC173Q0VFZ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms