Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBRQ0VD83 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms