Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD300CQ08708 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms