Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP3CAQ08209 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP3CAQ08209 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms