Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABPB1Q06547 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms