Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms