Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RELQ04864 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RELQ04864 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RELQ04864 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RELQ04864 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELQ04864 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELQ04864 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELQ04864 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELQ04864 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELQ04864 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELQ04864 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELQ04864 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELQ04864 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELQ04864 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RELQ04864 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms